Идеальным источником тепла может стать вода ближайшего водоема или реки. При этом используется тепловой насос типа «вода-вода». Хотя устройства типа «вода-вода» и не отличаются от насосов, работающих с «рассолом», но благодаря тому, что зимой температура теплоносителя более высокая, годовая эффективность применения таких насосов оказывается наивысшей. Контуром такого теплообменника является пластиковая труба с антифризом, которая с дополнительными грузами укладывается на дно водоема.

Хотя часто размеры водоема не позволяют применить этот метод для получения тепла (в некоторых случаях необходимо проконсультироваться в службе Госводонадзора), он имеет ряд преимуществ. Среди них и относительно небольшая длина контура, и всегда положительная температура окружающей среды зимой, и высокий коэффициент преобразования тепловой энергии воды водоема тепловым насосом.